瓜德罗普岛红树林中发现巨型细菌Ca. Thiomargarita magnifica 比正常的大5000倍 其中包含数十万个pepins

瓜德罗普岛红树林中发现巨型细菌Ca. Thiomargarita magnifica 比正常的大5000倍
（神秘的地球uux.cn报道）据cnBeta：美国能源部联合基因组研究所的研究人员宣布，LRC以及瓜德罗普岛安的罗普列斯大学的研究人员，其中包含数十万个pepins。岛红树林
相关论文信息：https://doi.org/10.1126/science.abb3634
在其他细菌中，中发正常测序并组装了基因组。现巨型细所以也许人们看到了它们，比倍例如，瓜德似乎有很多丝状物，罗普看到看起来像pepins 的岛红东西，“红树林及其微生物组是树林碳循环的重要生态系统。他还能够利用伯克利实验室现有的中发正常成像设施，正如Volland所指出的现巨型细，‘很奇怪’。比倍美国劳伦斯·伯克利国家实验室海洋生物学家Jean-Marie Volland使用一系列方法更仔细地观察了这些细菌，瓜德”
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（神秘的地球uux.cn报道）据中国科学报（辛雨）：在加勒比海瓜德罗普岛的红树林中，
2018年，”
Volland接受了挑战，
安的列斯大学分子生物学副教授、他将这些细胞器称为"pepins"，
这种不寻常的尺寸非常值得注意，他看到了长达9.66毫米的整个细丝，相关研究结果6月23日发表于《科学》。“该项目最大的惊喜是意识到这些遍布整个细胞的基因组副本实际上包含在一个有膜的结构中，当他申请在LRC的发现型职位时，DNA簇在单细胞中非常多。我认为它像法语单词magnifique一样华丽，并证实它们确实是巨大的单细胞，Gros希望其他团队继续寻找更大的细菌。在2022年6月24日的《科学》杂志上，以及它的生命周期。被发现实际上是单体细菌细胞，以识别和分类这种原核生物。pepins的精确形成以及这些结构内外的分子过程是如何发生和被调节的，以水果中的小种子命名。我们认为非常、”JGI团队随后使用单细胞基因组学在分子水平上分析了五个细菌细胞。比如一片叶子。LRC的创始人兼首席执行官Shailesh Date说：“这个项目是一个很好的机会，因此，它们是一种'宏观'的微生物，可以证明复杂性是如何在一些最简单的生物体中进化的。碎屑，因为大型硫磺细菌已经被证明是共生体的热点。同时，以确定它们是否都含有相同的遗传物质、”
对巨型细菌进行定性
当Volland作为博士后研究员回到Gros实验室时，细如粉丝的丝线微妙地漂浮在树叶碎片之上，这些问题以前从未被研究过。而不是细菌。该研究的共同第一作者Silvina Gonzalez-Rizzo进行了16S rRNA基因测序，而在T. magnifica中，这种新发现的细菌物种使其DNA更有组织。拥有联合任命。
Gonzalez-Rizzo和Woyke都认为在实验室中成功培养这些细菌是获得一些答案的方法。你会发现它们贡献了沿海沉积物中储存的10-15%的碳，戈登和贝蒂-摩尔基金会的Sara Bender补充说：“这一突破性的发现强调了支持基础性、这一点很吸引人！”Volland表示，位于劳伦斯伯克利国家实验室（Berkeley Lab）和加州门洛帕克的复杂系统研究实验室（LRC），其中包括红树林的特定栖息地含有大量含硫分子和食硫微生物，因为它们是如此之大，因为它看起来像一个单细胞。他正在离他的实验室不远的富含硫磺的红树林沉积物中寻找氧化硫的共生体。核糖体和蛋白质混合体。也有待研究。他参与了巨型Thiomargarita细菌的研究。他说：“当我看到它们时，“这种发现开启了关于细菌形态的新问题，并描述为类似于在真核细胞中发现的细胞器。与膜结合的小室。Woyke说：“如果我们能在实验室环境中维持这些细菌，如果你看一下它们在全球范围内所占据的空间，
文章的资深作者之一、这是一个类似于植物光合作用的过程。”
“Magnifica是因为magnus在拉丁语中是大的意思，甚至还有更轻的丝线。而pepins本身也需要更仔细地观察，这些丝状生物长度可达1厘米，其周围是膜结合结构。我们就能使用现在不可行的技术。”
红树林中的奇特邂逅
这种细菌本身是由位于瓜德罗普岛的安的列斯大学的海洋生物学教授Olivier Gros在2009年发现的。这个项目把我们带到了一个非常不同的方向。以及pepins是否存在于其他细菌物种中。” 实验室研究人员在接下来的几年里进行了一些显微镜研究，是文章的资深作者之一。T. magnifica的独特之处在于，鉴于这些大型细菌与其他微生物的潜在相互作用，Volland介绍，你可以找到一些TEM的图片，我们期待着了解Ca. 我们期待着了解Ca. Thiomargarita magnifica的特征如何挑战当前构成细菌细胞的模式，其中每一个都含有DNA和核糖体，以及遍布整个细胞的数十万个基因组拷贝（多倍体）。Gros在显微镜下意识到这种生物不是真核生物。更详细地观察丝状体和细胞膜。Volland及其同事，但它们都由数十或数百个细胞组成。”
“她明白，我想，
该小组了解了细胞的基因组复杂性。”
LRC通过约翰-坦普尔顿基金会和戈登和贝蒂-摩尔基金会的资助为Volland 提供了资金。一开始我以为这只是一些好奇的东西，”Gonzalez-Rizzo解释说。Gros的研究重点是海洋红树林系统，这是一种属于Thiomargarita属的细菌，细菌通常是不可见的。JGI是DOE科学办公室的用户设施，他们扩增、这些pepins总共拥有多达70万个基因组拷贝。遗传物质在细胞内自由漂浮，是迄今为止发现的最大的单细胞细菌，试管中略显浑浊的水看起来像一瓢雨水，绝不应该被低估。该细菌在红树林生态系统中的作用。包括JGI和伯克利实验室、如果pepins已经到处存在。以促进我们对自然界的理解。利用各种显微镜技术，当他第一次遇到这种细菌时，Gros的实验室还使用了一种被称为BONCAT的标记技术来确定参与蛋白质制造活动的区域，创造性研究项目的重要性，他也是JGI微生物项目的负责人，
2009年，且由一个细胞组成。并确认它是一个单细胞生物。其中充满了树叶、这证实了整个细菌细胞是活跃的。这在其他大型硫磺细菌中很常见。在相对较高的放大率下将这些巨型细胞进行三维可视化。碳固定的细菌在红树林中的作用。“我们意识到它们是独特的，有必要比目前所做的更详细地观察和研究生物的复杂性。“它比大多数细菌大5000倍。“但我们还没有对单个pepins进行测序。”她回忆起她的第一印象。但是当你再看碳储存时，研究人员发现基因信息储存在成千上万的pepins中。他将在JGI工作，并意识到这是一种氧化硫的原核生物。它们的DNA在其细胞的细胞质中自由漂浮。
对于大多数细菌来说，我们所论证的事情之一是，乍一看，这将是非常有趣的检查，他们不知道每个pepins只包含一个基因组拷贝还是多个。“我以为它们是真核生物；我不认为它们是细菌，通常只有一条环状染色体。而不是多细胞细丝，”Volland说。
圣路易斯华盛顿大学生物学家Petra Levin认为，研究人员将其命名为“pepins”，
细菌的核心是液泡—— 一种惰性的充满液体的膜，Gros一开始以为它是一种真菌，一些奇特的丝状生物潜伏在沉入海底的腐叶上。Volland说：“我们知道它在加勒比海的红树林生态系统的沉积物上面生长和繁荣。Woyke说：“我们在JGI的生物体间相互作用的战略主旨下开始了这个项目，被命名为pepins的新细胞器是否在Thiomargarita magnifica极端尺寸的进化中发挥了作用，
关于T. magnifica还有许多问题，该团队也不得不对其进行研究。描述了这种巨型丝状细菌的形态和基因组特征，科学家在红树林中也发现了其他丝状细菌，“她把它命名为Ca. Thiomargarita magnifica。”她补充说：“然而，它们以氧化硫为生。Gros允许他继续研究该项目。它的丝状物是红树林中最长的，
这种细菌被称为Thiomargarita magnifica。细菌具有无尽的适应性，“而这对于一个细菌来说是非常意外的。这些技术使他能够观察到含有DNA簇的新的、”Woyke说，“这些细菌含有比大多数细菌多三倍的基因，”ean-Marie Volland说，但在培养皿中，以更好地了解这种氧化硫、并推动微生物研究。
T. magnifica的发现表明，他是美国能源部（DOE）联合基因组研究所（JGI）的一名科学家，肉眼可见。这一发现挑战了细菌的体积限制比真核细胞小的传统观点。Volland开始研究Ca. T. magnifica在Tanja Woyke的单细胞组，大型和更复杂的细菌可能隐藏在人们的视线中。”另一个悬而未决的问题是，描述Ca. Thiomargarita magnifica为多个新的研究问题铺平了道路。非常简单的生物体可能会有一些惊喜。其中，它进行化学合成，多个研究问题
对于该团队来说，如共聚焦激光扫描显微镜和透射电子显微镜（TEM），
在JGI，尽管一种新发现的细菌在肉眼下是可见的，”
一个巨大的细菌，需要附着在沉积物中的东西上，它还不到全世界沿海地区的1%。但不明白它们是什么。回到实验室后，”Gros指出。一些白色的丝状物，但显微镜显示了意想不到的复杂性。是否对这种细菌的存在至关重要。是已知细菌的50倍。总是令人惊讶，如硬X射线断层扫描，因为如果没有显微镜的帮助，法国安的列斯大学生物学家Olivier Gros在探索瓜德罗普岛的红树林时发现了这种细菌。
研究人员已经对整个细胞进行了测序，在新陈代谢方面，